El cerezo presenta incompatibilidad polen-pistilo, por lo que es necesario el uso de árboles polinizadores para obtener cuajado de frutos. Así, en esta especie, la autoincompatibilidad resulta en un incremento de los costes y en una producción más errática y menos uniforme.Estos problemas pueden ser minimizados mediante el uso de variedades autocompatibles, por lo que la autocompatibilidad es un objetivo prioritario en la mejora del cerezo.