En los últimos 35 años de investigación de los agentes de biocontrol en poscosecha se han llevado a cabo considerables avances y la comercialización de algunos productos. No obstante, todavía existen numerosos desafíos y obstáculos que dificultan la implementación de su uso como una estrategia de control a gran escala.

Las características que debe reunir un agente de biocontrol ideal para su desarrollo comercial fueron ya descritas por Wilson y Wisniewski en 1989 y son:

• Genéticamente estable.
• Eficaz a baja concentración.
• No exigente en sus requerimientos de nutrientes.
• Capacidad para sobrevivir en condiciones ambientales adversas.
• Efectivo contra una amplia gama de patógenos en diferentes productos.
• Susceptible de producción en medios de crecimiento económicos.
• Susceptible de formulación con una larga vida útil.
• Fácil de aplicar.
• Resistente a los productos químicos utilizados en el entorno de poscosecha.
• No perjudicial para la salud humana.
• Compatible con los procedimientos de procesamiento comercial.

Los biopesticidas muchas veces requieren de un manejo y aplicación específicos por tratarse de seres vivos y en ocasiones este hecho no es bien entendido por los productores, comerciales y minoristas, además en ocasiones su actitud es negativa frente a esta nueva alternativa a los productos químicos.

Un mayor conocimiento de los sistemas de la comunidad microbiana conducirá al desarrollo de consorcios naturales o sintéticos que se pueden utilizar para prevenir las enfermedades en poscosecha y mitigar los trastornos fisiológicos en los productos cosechados.