El programa de mejora genética de la raza Assaf utiliza como criterio de selección además de la producción de leche (PL), el porcentaje de proteína (PP) y porcentaje de grasa (PG), ambos relacionados con la calidad de la leche y el rendimiento quesero. Igualmente, desde una perspectiva de calidad higiénico-sanitaria, el Recuento de células somáticas (RCS) es un indicador de la salubridad de la ubre, y permite la eliminación precoz de animales con mamitis clínicas o subclínicas, pudiendo aplicar incentivos económicos en la venta. En el presente trabajo han sido estudiados factores genéticos relacionados con la producción y calidad de la leche, así como su calidad higiénico sanitaria en ovejas de raza Assaf, utilizando como estrategia análisis de asociación de genoma completo (GWAS) con plataformas de genotipado masivo de marcadores SNPs, y la posterior validación de resultados a través del genotipado en toda la población mediante KASP. En resumen, hemos identificado 2, 6, 3, 15, 25 y 5