Autores: PALACIO BIELSA, A., BERRUETE, I.M., PALOMO, J.L., IRIBARREN, J., SASTRE, S., CUESTA MORRONDO, S., MARTÍN, L., CUBERO, J.astre, S.; Cuesta Morrondo, S.; Martin, L.; Cubero, Jaime
Publicación: V Reunión del grupo especializado en detección, diagnóstico e identificación
Fuente: citaREA
Año de publicación: 2023
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Utilización de genómica comparativa para el desarrollo de nuevos protocolos de PCR para la detección de tres patovares importantes de la especie Xanthomonas arborícola
Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap), X. arboricola pv. juglandis (Xaj) y X. arboricola pv. corylina (Xaj) son bacterias que ocasionan graves daños en Prunus spp., nogal y avellano, respectivamente.
En este trabajo, y mediante análisis de genómica comparativa, se han diseñado protocolos de PCR en tiempo real (qPCR), para Xap, Xac y Xaj, basados en elementos de los genomas identificados como específicos dentro de los tres patovares. Se seleccionaron los genes virB6 y htpG, correspondientes a una proteína de virulencia y una chaperona de respuesta a estrés, respectivamente, en Xap; el efector de virulencia avrXacE1 y un receptor de quimiotaxis tipo MCP de Xac; y un gen codificante de una enzima celulolítica y un transportador tipo TonB en Xaj.