La peligrosidad del ToBRFV radica en que es un virus muy persistente, fácilmente transmisible, y los síntomas son muy similares a otros virus que afectan a cultivos hortícolas como PepMV (virus del mosaico del pepino), lo que le hace pasar desapercibido.

En tomate los síntomas varían según variedades. Por lo general, en las hojas se manifiestan mediante clorosis, mosaico verde oscuro - verde claro y moteado con deformaciones en las horas. En ocasiones aparecen manchas necróticas en pedúnculo, cáliz y peciolo. En el fruto se observan manchas amarillas o marrones que pueden llegar a confundirse con los síntomas del PepMV.

En pimiento puede observarse deformación, coloración amarillenta y mosaico en las hojas. Los frutos se deforman con áreas amarillas o marrones o rayas verdes.