X. fastidiosa invade el xilema de la planta hospedadora. Su multiplicación en el interior de los vasos puede llevar a la obstrucción del flujo de savia bruta, principalmente agua y sales minerales.

En algunos casos se corresponden con los síntomas típicos de estrés hídrico: marchitez o decaimiento generalizado y, en casos más agudos, la seca de hojas y ramas, y finalmente la muerte de toda la planta. En otros casos los síntomas se corresponden más a los provocados por ciertas deficiencias de minerales, salinidad, exceso de nutrientes, etc. observándose clorosis internervial o moteado en hojas. En los brotes afectados se observa un oscurecimiento de los vasos del xilema al realizar un corte transversal.

Existen también hospedantes asintomáticos, es decir, plantas infectadas que no presentan signos externos de la enfermedad.